Según Keralolpathi, el templo Kizhthali Siva existió durante el reinado Perumal (113 a.C. — 343 d.C.). Durante la época de la dinastía Chera —que eran shaivates creyentes del Señor Shiva— los reyes tenían muchos asesores, generalmente nambuthiris. Estos ministros o consejeros habitualmente se reunían en un templo de Shiva llamado Thali. Había muchos templos de Shiva alrededor de este templo principal, como Melthali, Nediyathali y Chingapuram Thali.
El templo Kizhthali fue destruido primero por los portugueses y luego por los holandeses. El ejército de Tipu continuó después su destrucción, excepto el garbagriham, que sigue en pie. En su esplendor original, el templo presumía de un Koothu Parambu, un Kalari Parambu y un Kalapura Parambu. Actualmente es mantenido por el Departamento de Arqueología, llevándose a cabo las actividades religiosas por una fundación privada. El templo está situado en la carretera de Paravur-Kodungallur.