Der pontifikale Schrein von Marthoma ist ein wichtiges Pilgerzentrum unter dem Muziris Heritage Project. Die auch als pontifikaler Schrein von Marthoma bekannte Kirche an den Ufern des Flusses Periyar liegt ca. 6 km von Kodungallur entfernt, im Dorf Azhikode in Kerala. Man glaubt, dass der Apostel Thomas am 21. November 52 n.Chr. in Kodungallur ankam. Er soll sieben Kirchen in Kerala gegründet haben, von denen die erste in Kodungallur selbst liegt. Der Knochen des rechten Arms des heiligen Thomas wurde aus Ortona in Italien gebracht und in den vorhandenen pontifikalen Schrein eingesetzt. Seitdem ist der Schrein in Azhikode ein wichtiges Pilgerzentrum, das Tausende aus aller Welt anzieht, unabhängig von Klasse und Glauben.
'Marthoma Smruthi Tharangam' neben dem Schrein, das aus der Sanskrit-Sprache stammt und 'die Schaffung von Wellen von Erinnerungen an den heiligen Thomas' bedeutet, bietet eine Erinnerung an die Mission des Apostels. Ein 3500 m2 großes, im indo-persischen Stil erbautes Landhaus zeigt die wichtigsten Episoden im Leben des heiligen Thomas. Das 30minütige Programm nutzt die Hilfe moderner Computertechnologien und audiovisueller thetralischer Effekte.